Un groupe mysterieux d'hommes regarde des diapositifs et discute de Jarod , Miss Parker , Sydney , Broots , Mr Parker , Mr Raines ("he's …dead") , Mr Lyle et Ethan . Ils discuttent aussi des secrets du Centre et se demandent si Jarod , Ethan et Miss Parker sont toujours vivant après l'explosion du métro .
Jarod , Ethan et Miss Parker sont dans la rame du métro , puis tout explose . Dans les débris , Miss Parker est vivante , sa mère Catherine Parker lui tend la main et lui dit que son père connaît tout les secrets . En fait Miss Parker était sous hypnose et revivait auprès de Broots et de Sydney ce rêve reccurent (qu'elle considère comme prémonitoire) . Elle leur affirme qu'elle compte bien découvrir tout ces secrets .
Ethan et Jarod sont sains et sauf s. Ethan annonce à Jarod , que ses voix interieures l'informent que Miss Parker est toujours vivante . Ils regardent les informations qui parlent de l'explosion du métro puis de la dernière victime du serial Killer The Chameleon . La victime , qui est agent de la NSA , Edward Ballinger ,est une ancienne connaissance de Jarod : Eddie était l'ami de Jarod au Centre .

Miss Parker et Broots se rendent chez Mr Parker mais ce dernier ne s'y trouve plus . Miss Parker découvre que son père a visionné la DSA de la dernière rencontre Miss Parker /Raines avant que Raines ne reçoive une balle tirée par Mr Parker et que le dernier appel de Mr Parker avant sa "disparition" était pour Mr Lyle .

Au Centre , Miss Parker , accompagnée de Broots ,désire des explications de la part de son frère au sujet de la nouvelle disparition de leur père . Mais Lyle n'en donne aucune . En revanche il en profite pour leur faire admirer son nouveau pouçe transplanté , qui appartenait "jadis" à Mr Raines .

Puis Lyle s'en va rejoindre ses deux secrétaires asiatiques.

Jarod introduit la NSA et se présente auprès des 2 agents Tracer et Zane , puis ils discutent de The Chameleon . L'agent Zane dit alors à Jarod que the Chameleon est un serial killer qui "peut devenir qui il désire" .

Miss Parker parle avec Sydney de Jarod . La conversation les conduit au sens interieur de Miss Parker . Sydney lui demande si dans ses rêves elle voit une bague brillante . elle lui dit que oui et Sydney lui répond que sa mère la voyait aussi et lui avait demandé de l'aider à dévellopper son sens interieur . Miss Parker lui demande alors la même chose , mais Sydney refuse car après avoir aidé Catherine , cette dernière avait connu la mort .

La NSA a localisé le dernier lieu où se trouve The Chameleon . Mais sur place , ils ne trouve personne . Jarod retrouve des photos de lui (avec plusieurs uniformes) et les dissimule à ses collègues de la NSA .
Au Centre , Sydney hypnothise Miss Parker pour l'aider à trouver des réponses et lui demande ce que lui disent ces voix interieures . Broots décide de noter ce que Miss Parker répéte : "T.T , T.T , T.T"

Jarod décide d'appeler Sydney par visioconférence pour lui donner des nouvelles , lui dire qu'il est toujours vivant , ainsi que prendre des nouvelles de Miss Parker .

Pendant ce temps , Ethan regarde les photos que Jarod a retrouvé dans le repére du Chameleon , et répéte ce que ses voix interieures lui disent : "Double T. , Double T."

Dans les bureaux de la NSA , Jarod reçoit un appel de The Chameleon qui lui dit entre autre :"Je suis toi , Tu es moi , nous sommes pareils".

La NSA a localisé l'appel , Jarod et l'Agent Zane se rendent sur les lieux qui les conduit tout droit dans la chambre d'hopital de Eddie .

Une fois seul avec Jarod , Eddie menace avec un pistolet Jarod , étant sûr que le Centre a manipulé le cerveau de Jarod . Mais Jarod reussit à le convaincre du contraire . Puis ils discuttent sur le fait qu'ils ont l'impression tout les deux que The Chameleon connaît leurs existences . Eddie annonce alors à Jarod que The Chameleon est très interressé par une simulation d'Eddie : "Star Point". Alors que Jarod demande à Eddie si les initiales "T.T." lui disent quelques choses , un hélicoptère se met au niveau de la fenêtre de la chambre et à l'interieur The Chameleon tire sur Eddie . Avant de mourir , Eddie dit à Jarod que The Chameleon "était un homme mort" .
Alors que Miss Parker conduit , elle est replongée dans son rêve réccurent et manque d'écraser Broots .
Ce dernier lui donne enfin des infos sur les initiales "T.T." : il s'agit du Docteur Tommy Thompson , un employé du … Centre .

Alors que Zane et Jarod discuttent de la mort d'Eddie , Jarod reçoit un nouvel appel de The Chameleon .La NSA a localisé l'appel : The Chameleon a appelé de Bluecove , au Delaware .

Au Centre , Sydney apprend à Miss Parker que son père , pour une raison inconnue n'aimait pas le Dr Thompson . Puis Broots arrive et informe Miss Parker que Mr Lyle semble le connaître .

Jarod et les Agents Zane et Tracer se trouvent en fâçe de l'entrée du Centre , où se trouve une caravane , où The Chameleon a passé l'appel .

Alors que Jarod est à l'interieur de la caravane , Tracer a une discussion avec Lyle , en plein jogging matinal , qui présente à Tracer le Centre comme un institut de recherche .

Miss Parker qui veut savoir qui est Thompson , décide interroger Lyle et elle n'obtient pas de réponse satisfaisante . Elle décide donc de suivre Lyle , avec Broots. Jarod demande à Sydney de retrouver la simulation Star Point .

Lyle se rend au Sous-Terrain 20 , l'infirmerie , et Miss Parker et Broots découvrent que Raines est toujours vivant .

Miss Parker et Brots assistent à la scène , cachés derrière les rideaux .
Raines se reveille , attrape le nouveau pouçe de Lyle , et dit "Je veux qu'il revienne" .

Ce à quoi , Lyle répond , "et moi je veux des réponses !"

Examinant de plus près les photos , Jarod et Ethan découvrent qu'il y a un message caché .Sur chaque photo , "une lettre" apparaît .

Le G. Le H. Le O. Le S. Le T.

G.H.O.S.T. Jarod comprend que The Chameleon est un fantôme" pour lui .

Sydney n'arrive pas à croire que Raines soit encore vivant . Mais il est certain que Raines est lié à Catherine Parker et Tommy Thompson .

Dans les bureaux de la NSA , Jarod reçoit un colis de The Chameleon : à l'interieur s'y trouve un cahier rouge , avec la photo de sa mère (avec des larmes rajoutées au stylo ) et une invitation pour Jarod dans le parc de Els Grove . La nuit Jarod se rend donc au Els Grove Park et finit par trouver une tombe . En l'ouvrant il découvre "une colombe à papier" , riche en symbole pour lui . Quelues semaines avant son évasion , alors qu'il apprenait à Eddie comment faire une colombe à papier , les deux amis rencontraient pour la première fois un autre pensionnaire du Centre : Alex .

Lyle reçoit l'ordre au téléphone de tuer Raines . Sydney qui a tout entendu , prévient Miss Parker . Elle avertitt Raines qu'elle le sauvera de Lyle à condition qu'il réponde à toutes ses questions sur Tommy Thompson . Raines accepte et demande d'être refugié chez Mr Parker .Une fois sauvée , Raines avoue tout . Tommy Thompson est liè en quelques sortes à l'évasion de Jarod .

Raines leur avoue que Mr Parker déteste Thompson car Mr Parker blame le docteur Thompson de l'évasion de Jarod . Raines est étonné que Sydney ignore tout sur l'évasion de Jarod . Jarod ne s'est pas échappé seul , il était avec Eddie et Alex , deux autres Pretender

Au même moment , Jarod explique à Ethan comment il s'est echappé , et que lors de l'évasion , Alex est tombé d'une plate forme du Centre . Mais apparement , Alex est toujours vivant.

Alex , se prépare à devenir Agent de la NSA , et retire la cagoule de son prisonnier : Mr Parker .

Au Centre Broots a retrouvé la discussion entre Mr Parker et Lyle et la donne à Miss Parker qui entend son père demander à Lyle d'arrêter son fou .

Miss Parker retrouve son frère et après quelques souffrances , Lyle avoue tout ,Alex a kidnappé Mr Parker et explique qu'il était en charge d'Alex après son évasion ratée .

Lyle l'a conduit au Triumvirat en Afrique et a essayé de le façonner mais ça a été un echec . Alex a commençé a se reporter directement au Triumvirat et Lyle ne pouvait plus le controler . Maintenant il veut se venger .

Mais les voix interieures rassurent Miss Parker : son père est toujours vivant . Broots , plus tard donne à Miss Parker 2 adresses oû elle peut retrouver le Dr Thompson . Miss Parker en choisit une et demande à Broots de se rendre à l'autre adresse .

Ethan regarde son écran d'ordinateur où se trouve deux adresses au nom de Thommy Thompson . Il appele Jarod pour lui communiquer l'adresse et l'informe qu'il doit le quitter car il doit retrouver sa sœur Miss Parker , qui court un grave danger .

Jarod reçoit un nouvel appel d'Alex et parlent ensemble de "la belle vie" au Centre , alors qu'au même moment , Alex modifie son empreinte digitale , se coupe l'un des doigts de sorte qu'il saigne et laisse ses emprunes "ensanglantées" sur un mur .

Miss Parker se rend au Maryland , à l'adresse donné par Broots , et y retrouve une bague appartenant à sa mère . Mais quelques secondes plus tard , tout explose . Miss Parker se reveille dans les débris et vit enfin son rêve prémonitoire pour de vrai …Dans un état hypnotique elle croit voir sa mère , mais en réalité c'est Ethan qui vient la sauver .

Jarod et les agents de la NSA se rendent dans le dernier repaire où Alex a appelé , et retrouve sur plaçe Tommy Thompson …mort . puis Jarod entend du bruit , ouvre un placard et retrouve … Broots .

Ethan et Miss Parker retourne chez Mr parker et apprennent de Sydney , qui vient d'envoyer à Jarod la simulation Star Point , que Raines est parti et qu'il n'a eut aucune nouvelle de Broots .

Dans les bureaux de la NSA , Jarod et l'agent Zane font passer un interrogatoire à Broots . Jarod reussit à convaincre Zane que Broots n'est pas le meurtrier de Thompson .

Ethan comprend que ses voix interieures l'ont guidé pour aider Jarod à retrouver Thompson et pour sauver Miss Parker .

Alors que Jarod prépare les papiers administratifs pour libèrer Broots , il reçoit un appel de Sydney . Sydney a reussit à découvrir le prochain "sale coup" d'Alex . Cela se passera à l'ambassade de Suede .

L'agent Zane reçoit les résultats de l'analyse des empreintes digitales retrouvées chez Thompson . Ce sont celle de Jarod . Elle en déduit que Jarod est The Chameleon et décide de l'arreter . Jarod et Broots s'enfuit ensemble de la NSA , traqués par Zane et ses hommes et prennent la voiture .

Chez sa mère , Miss Parker reçoit un appel de son père , menaçé d'un pistolet par Alex et lui donne le lieu pour le trouver .

En voiture , Broots raconte les derniers évènements au Centre à Jarod : les cauchemards de Miss Parker, le nouveau pouçe de Lyle , le pouçe manquant de Raines qui est toujours vivant , Mr Parker kidnappé par cet autre pretender Alex . C'est à ce moment là que Jarod s'arrête et demande à Broots de sortir de la voiture .

Arrivé à l'ambassade , Jarod reussit à éviter la catastrophe et poursuit Alex . Mais Jarod se retrouve bloqué , séparé d'Alex par une grille . Alex s'enfuit et Jarod est rattrapé par Zane et ses hommes . Jarod leur demande de lui faire confiance et l'un des hommes de la NSA , affirme qu'il est témoin que Jarod a sauvé les invités de l'ambassade .

Jarod appele Ethan et reussit à savoir où est partie Miss Parker et donc où se trouve Mr Parker et Alex .

Miss Parker reussit à liberer son père , mais au moment où elle allait le déligoter , Alex arrive . Il avoue une terrible verité à Miss Parker . Mr Parker n'est pas son père . Jarod arrive et se bat contre Alex , une balle du pistolet ricoche sur Mr Parker qui s'éffondre par terre . Alex s'enfuit et Jarod le poursuit .

Ils arrivent sur une plate forme , Alex dit à Jarod qu'il est stupide si il croit que Le Centre le traque depuis 5 ans seulement car c'est un Pretender , il y a plus que ça , quelque chose qui a à voir avec QUI est Jarod . Alex trébuche , Jarod le rattrape , mais Alex se laisse tomber .

LE CLIFFHANGER

Miss Parker et Jarod sont au téléphone . Miss Parker lui dit qu'on a pas retrouvé le corps d'Alex , qu'elle ne sait pas où se trouve Broots , qu'Etha, a aussi disparu , laissant derrière lui un texte inachevé et que son père (si c'est bien lui) est inconscient . Elle dit alors à Jarod qu'elle ne sait plus qui elle est , ce à quoi Jarod répond "Bienvenu au Club" . Puis ils reçoivent tout deux un email : une photo de Catherine Parker avec la mère de Jarod .

Dans une salle du Centre , Mr Raines apprend que son mail a bien été envoyé . Puis il dit "We're even now , my children" (Nous Sommes Quites Maintenant , Mes Enfants ) , en fixant la photo de Catherine Parker et Margaret , la mère de Jarod …

FIN